Nature:全新有毒机制,相分离驱动异常染色质成环,促进癌症发展

2021-11-29 05:11 来源:泉州妇科医院

前列腺癌的发展与小分子细胞内质内在无序区域(IDR)的遗传异常密切系统性。各种细胞内质(包括核糖体因子、肌动细胞内调节剂和RNA混合细胞内)之中的IDR通过混合器物-相态分离出来(LLPS)成型孕育器物,严重影响从细胞内器成型和刺激耐受到遗传核糖体的无数生器物步骤。

所谓的混合器物-相态分离出来(LLPS)是指交融两个不系统性遗传突变的步骤。该步骤再次发生在细胞内核内,并只能成型不具备各种器物理特病态的域,这些域可以倡导前列腺癌,例如急病态肺癌的再次发生发展。在急病态肺癌之中,大分子细胞内(NUP98或NUP214)的单调性染色体易位产生了一种异常交融体,它总是保留大分子细胞内 IDR——苯丙氨酸和胺基酸残基(FG)的并联转移单调序列。然而,IDR如何导致遗传错误介导和再次发生尚不清楚。

2021年6月23日,北阿拉巴马大学教堂山两所 Gang Greg Wang 制作团队等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究课题研究成果。

该研究课题得出结论交叉是前列腺癌成型的液压因素,前列腺癌通过交叉得到突变以组织起来有毒核糖体因子孕育器物,这同时减慢了它们的遗传小分子病态并在转成步骤之中游离异常贴图肌动细胞内结构的成型。该研究课题是最早将交叉与前列腺癌成型联系起来的研究课题之一。因为在其他恶病态之中观察到了相近的遗传交融,文章之中阐明的功能也可以推论其他特性的前列腺癌。

NUP98–HOXA9包涵两个细胞内质基序和一个混合序列。为了研究课题NUP98-IDR在肺癌再次发生之中的关键作用,研究课题制作团队主要用作掰除了混合序列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们发现,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种运用于冲击相-交叉孕育体的化学器物质)处理引人注意。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)细胞内在体外成型混合器物体孕育器物。

为了大幅度分析报告FG单调序列对孕育器物成型的ppm贫乏病态和多价病态的重要病态,研究课题制作团队氢化了富含不同数量FG单调序列的改组N-IDR细胞内质。他们发现N-IDR包涵38个或36个FG以ppm贫乏病态的方式单调成型的混合器物滴,那些包涵27个或11个FG的却不能来进行交叉。说明了NUP98–HOXA9之中的IDR以价贫乏和ppm贫乏的方式组织起来LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源糖细胞内与DNA混合,导致肺癌再次发生步骤之中的遗传失调。紧接著,研究课题制作团队通过肌动细胞内免疫沉淀和高通量测序来分析报告IDR系统性联的交叉对NUP98–HOXA9肌动细胞内小分子病态的严重影响。

调查结果, N-IDRWT/A9不具备夙着减慢的遗传市场份额,而与无监督聚类定义的千分之亚类都是。此外,宽而密集的;也减慢子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和肺癌系统性遗传富集。

为了大幅度分析报告IDR游离的LLPS在不系统性的体肌动细胞内小分子之中的关键作用,他们来来进行了免疫学和生理学的作法,得出结论IDR系统性联的LLPS在减慢不系统性的核糖体因子小分子病态方面的因果关键作用,特别是在;也减慢子样峰处看见的那些。说明了IDR减慢交融体的遗传混合并且减慢靶遗传启动时。

为了验证NUP98–HOXA9通过LLPS成型肌动细胞内反向的能力,研究课题制作团队生成了隐含N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞内的Hi-C图谱,探究了DNA反向和复制两者之间的高度系统性病态。

为了明确N-IDRWT/A9对Hi-C接触频率的严重影响,他们聚集了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9隐含细胞内之中500个最强烈的N-IDRWT/A9占据位点两者之间的相互关键作用枚举。调查结果,N-IDRWT/A9反向以基本上与CTCF都是的方式成型,与交叉液压功能一致。另外,N-IDRWT/A9特异病态反向重新连接减慢子和靶遗传两者之间的连接,支持了交融核糖体因子的IDR通过交叉在;也减慢子样靶点和细胞增殖两者之间游离DNA反向的论者。

综上所述,该研究课题发现NUP98–HOXA9之中富含的LLPS活病态IDR对肺癌的再次发生和有毒特异性程序的启动时至关重要。这些效应由IDR的能力系统性联:1)减慢核糖体因子与遗传靶点的混合;2)倡导减慢子和细胞增殖启动子两者之间的长距离反向。

该研究课题发放了一个有毒突变的原理病态论据,该突变在转成步骤之中倡导LLPS液压的核糖体因子混合和3D肌动细胞内改组。由于含IDR的LLPS活病态分子与广泛的前列腺癌有关,该研究课题阐明的功能也可以推论其他特性的前列腺癌。

原始出处:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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